假臭草EST-SSRs标记的开发

从NCBI的dbEST数据库中下载假臭草同族植物的EST序列，经EST序列处理及SSR位点查询，首次设计了27对假臭草EST-SSRs引物，以海南省文昌市假臭草DNA为模板，采用单因素和L16(45)正交试验对其EST-SSRs PCR反应体系进行优化。建立了假臭草EST-SSRs最佳20 μLPCR反应体系：Mg2+浓度为2.75 mmol/L，模板DNA用量为35 ng，Tag DNA聚合酶为2.25 U，dNTPs浓度为0.3 mmol/L，引物浓度为0.6 μmmol/L。并用14个不同来源的假臭