云南绵羊mtDNA D-LOOP序列多态性研究

采用PCR-SSCP技术与mtDNAD-Loop序列分析相结合的方法，对我国云南昭通绵羊、腾冲绵羊、宁蒗绵羊3个地方绵羊品种共134个个体进行mtDNA序列多态性及起源进化研究。PCR-SSCP分析显示，在云南的3个绵羊群体中检测到线粒体编码区的Cytb和ND2基因的2种单倍型A和B。根据不同的单倍型从3个绵羊群体中共筛选出23个样品进行了mtDNAD-Loop区克隆测序，系统发育分析揭示袁，云南绵羊mtDNAD-Loop序列单倍型分为支系A和支系B两大类。基于PCR-SSCP和D-Loop区序列的分析结果一致提示云南绵羊存在支系A和支系B两大母系起源，对云南绵羊进行mtDNA D-Loop序列多态性分析，结果发现线粒体D-Loop区系列单倍型多样度Hd为87.5%～100%；核苷酸多样度Pi为0.21～0.26；平均核苷酸差异数k为22.9%～36.8%。此结果揭示云南绵羊遗传多样性相对贫乏遥对云南绵羊mtDNA D-Loop进行Mismatch分析和Tajima'sD值中性检验，结果显示，云南绵羊群体核昔酸差异数表现出完整的2个峰形，且经过中性检验不显著，由此推断云南绵羊在过去没有出现群体扩张，群体大小保持稳定。