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重庆邮电大学学报(自然科学版) 2006
植物miRNAs前体的生物信息分析Keywords: 拟南芥,miRNAs,最小自由能,长度,熵 Abstract: miRNAs前体(pre-miRNAs)是产生成熟miRNAs的基因表达产物,能形成较为稳定的发卡环结构,具有较低的最小折叠自由能(minimalfoldingfreeenergy,MFE)。在对植物pre-miRNAs长度、不同碱基含量、MFE、熵分析基础上,重点比较不同RNAs序列之间MFE与其长度的比值(MFEL)。结果表明MFEL是区分植物pre-miRNAs的一个很有效的参数:pre-miRNAs的MFEL值平均为45.98kcal/mol,明显低于mRNAs(23.08kcal/mol),tRNAs(22.13kcal/mol)和rRNAs(16.83kcal/mol)。使用MFEL参数可提高预测植物miRNAs基因的效率。
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