二维蛋白质模型分子在折叠过程中的构象研究

蛋白质在折叠过程中其构象要发生明显变化.采用精确计数法,计算了在蛋白质折叠的不同阶段其尺寸大小及其分布情况.发现在折叠的初期,分子的尺寸比较大,其分布也比较宽.在折叠的后期,分子的尺寸比较小,其分布比较窄.不同的氨基酸序列,其分子尺寸的分布也不同.对于可折叠的氨基酸序列,在平均尺寸大小附近出现的几率特别大.同时还计算了比值SN/DN.这里SN为可设计序列数目(Thenumberofdesigningsequences),DN为可设计构象数目(Thenumberofdesignableconformations),并有关系-1.684+0.3255N≤SN/DN≤-0.8664+0.3125N(N≥13)通过这些研究以提高对折叠过程的认识.