石杉碱甲-AChE复合物中石杉碱甲的结构特征:量子化学研究

在运用量子化学从头计算方法(HF/4-31G)结合点电荷模型方法对AChE-HupA复合物活性位点的410个原子和1929个点电荷进行理论计算的基础上,比较了石杉碱甲分子在形成复合物前后的结构变化特征。发现复合物中石杉碱甲分子构象并非能量最低构象,它的能量比HF/4-31G全优化得到的构象的能量高91.8kj/mol。和单分子状态相比,形成复合物后季铵基和内酰胺基的N-H,C=O键的键长变长、键强减弱,其总原子净电荷也发生了明显的变化。且这些基团的空间取向都有不同程度的改变,C(8)-N(21)键的旋转达20ⅲ。这些信息将有益于设计新的AChE抑制剂。