VEGFR2活性腔性质以及与抑制剂的结合模式研究

VEGFR2介导肿瘤诱导的血管生成作用,是抑制肿瘤生长和转移的新靶点.为深入探讨VEGFR2活性腔性质以及与抑制剂的结合模式,采用多拷贝同时搜寻法(MCSS)研究VEGFR2活性腔的性质,然后用分子对接方法对5个已上临床的VEGFR抑制剂与VEGFR2活性腔进行对接计算,讨论它们的结合模式,确定与配体结合相关的关键残基.研究发现疏水腔I,II是配体结合的关键区域,残基Glu915,Cys917是关键的氢键作用位点,Lys866,Glu883和Asp1044形成的极性区域对提高配体亲合力很重要,疏水腔III和极性腔IV是额外增强配体结合力的区域,IV区的Arg1030可提供额外的氢键作用位点.本研究可为全新VEGFR2抑制剂的合理药物设计提供理论依据,为寻找新的抗肿瘤药物奠定基础.