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化学学报 2006
HLA-A*0201限制性CTL表位定量结构与活性研究, PP. 949-952 Keywords: 细胞毒T细胞,表位,定量构效关系,遗传算法,偏最小二乘 Abstract: 采用VHSE氨基酸结构描述子表征HLA-A*0201限制性表位结构,以遗传算法和偏最小二乘相结合(GA-PLS)对102个训练集进行定量构效关系建模.剔除3个异常样本后,据候选模型交互检验及50个外部测试集预测结果,筛选得到最优偏最小二乘模型(A=2),其R2,Q2和分别为0.755,0.621和0.680.构效研究显示CTL表位活性主要与1,2,7,8,9位氨基酸残基疏水、1,2位立体及6位残基电性等性质密切相关.
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