应用连续小波变换预测蛋白质的二级结构

将代码为lgca蛋白质的氨基酸序列映射为疏水值序列，在合适的尺度下，通过连续小波变换法分别对其α螺旋,α螺旋和β折叠之间的连接多肽(即部分规则和无规则二级结构)进行预测，准确率分别为76．5％和85．7％．从PDBsum数据库中随机抽取100个蛋白质作为测试对象，其中全α螺旋、全β折叠、α／β以及α+β蛋白质各25个．在100个蛋白质中共有1618个连接多肽和747个α螺旋.本法预测到的连接多肽共有1536个，其中1308个与实际结构一致，平均预测准确率为85.2％；预测到的α螺旋有770个，其中581个与实际结构一致，平均预测准确率为75．5％．结果表明该法可较好地预测蛋白质的α螺旋、连接多肽，具有极大的发展前景．