神经介素B受体与拮抗剂、激动剂的分子模拟研究

大鼠神经介素B受体(ratneuromedinBreceptor,rNMBR)属于G蛋白偶联受体(G-proteincoupledreceptor,GPCR)A家族的成员.GPCR的结构特征和在信号传导中的重要作用决定了其可以作为很好的药物靶标.关于rNMBR与内源性激动剂神经介素B(neuromedinB,NMB)以及与非肽类拮抗剂pd168368作用机制的研究对于合理设计受体药物分子有重要的指导意义.在这一研究中,我们使用同源模建,构建受体的三维结构,进行分子对接和分子动力学的计算.基于受体三维结构,通过10ns的空载受体、激动剂-受体、拮抗剂-受体的分子动力学模拟,探讨受体与激动剂与拮抗剂的作用机制.研究表明rNMB-R中跨膜(transmembrane,TM)螺旋3,5,6,7参与配体的结合.NMB与受体的结合,使受体转变为活性构象,而受体同拮抗剂pd168368恰好相反.