应用MM/PBSA方法研究CDK2活性口袋内溶剂水分子对CDK2-配体结合自由能的影响
, PP. 255-260
Keywords: MM/PBSA,CDK2,结合自由能,溶剂水分子,分子动力学
Abstract:
应用MM/PBSA方法研究了CDK2活性口袋内溶剂水分子对CDK2-配体结合自由能的影响.结果表明,活性口袋内溶剂水分子对CDK2-配体相互作用自由能有一定的贡献,其贡献的大小随配体不同而有所差异,导致这种差异的主要原因是活性位点内溶剂水分子与蛋白残基和配体之间形成了不同的氢键相互作用网络.
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