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化学学报 2010
应用独立成分分析方法预测CTL表位, PP. 1821-1828 Keywords: CTL表位,独立成分分析,氨基酸描述符,定量构效关系 Abstract: 基于独立成分分析方法分别采用3z-scale和5z-scale氨基酸结构描述符,建立了抗原肽与MHC分子(majorhistocompatibilitycomplex,MHC)相互作用结合的定量构效关系模型.该两个模型训练集样本数是316,预测集样本数是786.结果表明3z-scale模型的预测准确度和AUC值分别为70.3%,0.70;5z-scale模型的预测准确度和AUC值分别为70.9%,0.79.本文建立CTL表位预测模型对进一步了解抗原肽与MHCI类分子相互作用机理具有一定的帮助.
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