全部 标题 作者
关键词 摘要

OALib Journal期刊
ISSN: 2333-9721
费用:99美元

查看量下载量

相关文章

更多...
化学学报  2013 

DNA骨架磷硫酰化修饰的研究进展

DOI: 10.6023/A12121120, PP. 501-507

Keywords: DNA,磷硫酰化,DndA-E,Dnd表型,综述

Full-Text   Cite this paper   Add to My Lib

Abstract:

DNA骨架磷硫酰化修饰是指在天然DNA骨架上发现的P—O键被P—S键替换的化学修饰,属于首例生理修饰,具有磷硫修饰的DNA在Tris缓冲体系中电泳时具有DNA降解表型.研究发现DNA骨架磷硫修饰属于复制后修饰,具有如下三个特征Rp型立体修饰,序列专一性、分布广泛性.这种修饰由五个基因组成的dnd基因簇(dndA-E)编码的蛋白控制,但这些蛋白具体的作用机制目前还不清楚.为了将来更好地研究DNA磷硫修饰机制,本文综述了DNA磷硫酰化修饰的发现历程,特点,参与DNA磷硫修饰的蛋白结构研究进展,以及磷硫修饰的DNA作为抗氧化剂研究进展.同时,对DNA磷硫修饰机制、生理功能等研究目前所面临的困难,如硫原子如何渗入DNA骨架,参与DNA磷硫修饰的五个蛋白是如何协调作用完成DNA磷硫修饰的机理等难题进行了简单概括,以为相关研究提出一些可能的方向.

References

[1]  Eckstein, F.; Gish, G. Trends Biochem. Sci. 1989, 14, 97.
[2]  Wang, L. R.; Chen, S.; Xu, T. G.; Taghizadeh, K.; Wishnok, J. S.; Zhou, X. F.; You, D. L.; Deng, Z. X.; Dedon, P. C. Nat. Chem. Biol. 2007, 3, 709.
[3]  Wang, L. R. Ph.D. Dissertation, Shanghai Jiaotong University, Shanghai, 2007. (王连荣, 博士论文, 上海交通大学, 上海, 2007.)
[4]  You, D. L.; Wang, L. R.; Yao, F.; Zhou, X. F.; Deng, Z. X. Biochemistry 2007, 46, 6126.
[5]  He, X. Y.; Ou, H. Y.; Yu, Q.; Zhou, X. F.; Wu, J.; Liang, J. D.; Zhang, W.; Rajakumar, K.; Deng, Z. X. Mol. Microbiol. 2007, 65, 1034.
[6]  Liang, J. D.; Wang, Z. J.; He, X. Y.; Li, J. L.; Zhou, X. F.; Deng, Z. X. Nucleic Acids Res. 2007, 35, 2944.
[7]  Wang, L. R.; Chen, S.; Vergin, K. L.; Giovannoni, S. J.; Chan, S. W.; DeMott, M. S.; Taghizadeh, K.; Cordero, O. X.; Cutler, M.; Timberlake, S.; Alm, E. J.; Polz, M. F.; Pinhassi, J.; Deng, Z. X.; Dedon, P. C. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2011, 108, 2963.
[8]  Warren, R. A. Annu. Rev. Microbiol. 1980, 34, 137.
[9]  McClelland, M.; Nelson, M.; Raschke, E. Nucleic Acids Res. 1994, 22, 3640.
[10]  Dyson, P.; Evans, M. Nucleic Acids Res. 1998, 26, 1248.
[11]  Lauhon, C. T.; Kambampati, R. J. Biol. Chem. 2000, 275, 20096.
[12]  Liesegang, A.; Tschape, H. Int. J. Med. Microbiol. 2002, 291, 645.
[13]  Koort, J. M.; Lukinmaa, S.; Rantala, M.; Unkila, E.; Siitonen, A. J. Clin. Microbiol. 2002, 40, 3497.
[14]  Silbert, S.; Boyken, L.; Hollis, R. J.; Pfaller, M. A. Diagn. Micr.Infec. Dis. 2003, 47, 619.
[15]  Murase, T.; Nagato, M.; Shirota, K.; Katoh, H.; Otsuki, K. Vet. Microbiol. 2004, 99, 139.
[16]  Xu, T. G. Ph.D. Dissertation, Shanghai Jiaotong University, Shanghai, 2008. (徐铁刚, 博士论文, 上海交通大学, 上海, 2007.)
[17]  An, X. H.; Xiong, W.; Yang, Y.; Li, F. H.; Zhou, X. F.; Wang, Z. J.; Deng, Z. X.; Liang, J. D. PLoS One 2012, 7, e51265.
[18]  Chen, F. K.; Zhang, Z. Y.; Lin, K.; Qian, T. L.; Zhang, Y.; You, D.; He, X. Y.; Wang, Z. J.; Liang, J. D.; Deng, Z. X.; Wu, G. PLoS One 2012, 7, e36635.
[19]  Yao, F.; Xu, T. G.; Zhou, X. F.; Deng, Z. X.; You, D. L. FEBS Lett. 2009, 583, 729.
[20]  Dai, J. H. J. Theor. Biol. 2012, 310, 249.
[21]  Deng, Z. X. China Basic Science 2008, 10, 17. (邓子新, 中国基础科学, 2008, 10, 17.)
[22]  Xu, T. G.; Yao, F.; Zhou, X. F.; Deng, Z. X.; You, D. L. Nucleic Acids Res. 2010, 38, 7133.
[23]  Zhou, X. F.; Deng, Z. X.; Firmin, J. L.; Hopwood, D. A.; Kieser, T. Nucleic Acids Res. 1988, 16, 4341.
[24]  Zhou, X. F.; He, X. Y.; Liang, J. D.; Li, A. Y.; Xu, T. G.; Kieser, T.; Helmann, J. D.; Deng, Z. X. Mol. Microbiol. 2005, 57, 1428.
[25]  Ra, T.; Weaden, J.; Dyson, P. FEMS Microbiol. Lett. 1992, 75, 247.
[26]  Evans, M.; Dyson, P. Trends Genet. 1993, 9, 72.
[27]  Ray, T.; Mills, A.; Dyson, P. Electrophoresis 1995, 16, 888.
[28]  Liang, J. D. Ph.D. Dissertation, Shanghai Jiaotong University, Shanghai, 2007. (梁晶丹, 博士论文, 上海交通大学, 上海, 2007.)
[29]  Lundblad, J. R.; Laurance, M.; Goodman, R. H. Mol. Endocrinol. 1996, 10, 607.
[30]  Hu, W.; Wang, C. K.; Liang, J. D.; Zhang, T. L.; Hu, Z. P.; Wang, Z. J.; Lan, W. X.; Li, F.; Wu, H. M.; Ding, J. P.; Wu, G.; Deng, Z. X.; Cao, C. Y. Cell Res. 2012, 22, 1203.
[31]  Zhang, Y. C.; Liang, J.; Lian, P.; Han, Y. W.; Chen, Y. F.; Bai, L. Q.; Wang, Z. J.; Liang, J. D.; Deng, Z. X.; Zhao, Y. L. J. Phys. Chem. B 2012, 116, 10639.
[32]  Xie, X. Q.; Liang, J. D.; Pu, T. N.; Xu, F.; Yao, F.; Yang, Y.; Zhao, Y. L.; You, D. L.; Zhou, X. F.; Deng, Z. X.; Wang, Z. J. Nucleic Acids Res. 2012, 40, 9115.
[33]  Eckstein, F. Nat. Chem. Biol. 2007, 3, 689.
[34]  Romling, U.; Tummler, B. J. Clin. Microbiol. 2000, 38, 464.
[35]  Marshall, S.; Clark, C. G.; Wang, G.; Mulvey, M.; Kelly, M. T.; Johnson, W. M. J. Clin. Microbiol. 1999, 37, 2473.
[36]  Zhang, Y. S.; Yakrus, M. A.; Graviss, E. A.; Williams-Bouyer, N.; Turenne, C.; Kabani, A.; Wallace, R. J. J. Clin. Microbiol. 2004, 42, 5582. Wong, H. C.; Chen, S. Y.; Chen, M. Y.; Oliver, J. D.; Hor, L. I.; Tsai, W. C. Appl. Environ. Microbiol. 2004, 70, 5153.

Full-Text

Contact Us

service@oalib.com

QQ:3279437679

WhatsApp +8615387084133