Van der Bruggen, P.; Zhang, Y.; Chaux, P.; Stroobant, V.; Panichelli, C.; Schultz, E. S.; Chapiro, J.; vall der Eynde, B. J.; Brasseur, F.; Boon, T. Immunol. Rev. 2002, 188, 5l.
[2]
Garboczi, D. N.; Ghosh, P.; Utz, U.; Fan, Q. R.; Biddison, W. E.; Wiley, D. C. Nature 1996, 384, 134.
[3]
Rammensee, H.; Bachmann, J.; Emmerich, N. P. Immunogenetics 1999, 50, 213.
[4]
Nielsen, M.; Lundegaard, C.; Lund, O. BMC Bioinformatics 2007, 8, 238.
[5]
Honeyman, M. C.; Brusic, V.; Stone, N. L. Nat. Biotechnol. 1998, 16, 966.
[6]
Hattotuwagama, C. K; Guan, P.; Docytchinova, I. A. J. Mol. Graph Modell. 2004, 22, 195.
[7]
Dong, S. M.; Song, Z.; Liu, T.; Zhu, M. H.; Liu, W. Acta Chim. Sinica 2010, 68, 1821. (董素梅, 宋哲, 刘涛, 朱鸣华, 刘伟, 化学学报, 2010, 68, 1821.)
[8]
Kessler, J. H.; Beekman, N. J.; Bres-Vloemans, S. A.; Berdijk, P.; van Veelen, P. A.; Kloosterman-Joosten, A. M.; Vissers, D. C; tenBosch, G. J.; Kester, M. G.; Sijts, A.; Wouter Drijfhout, J.; Ossendorp, F.; Offringa, R. Exp. Med. 2001, 193, 73.
[9]
Trautwein, N.; Stevanovi?, S. Methods Mol. Biol. 2013, 960, 159.
[10]
Liao, W. W.; Arthur, J. W. PLoS One 2011, 6, e25055.
[11]
Lee, Y.; Ferrari, G.; Lee, S. C. Biomed. Microdevices 2010, 12, 207.
[12]
Binkowski, T. A.; Marino, S. R.; Joachimiak, A. PLoS One 2012, 7, e41710.
[13]
Humprey, W.; Dalke, A.; Schulten, K. J. Mol. Graph. 1996, 14, 33.
[14]
Yael, A.; Hanah, M. Methods 2004, 34, 454.
[15]
Song, Z.; Liu, T.; Liu, W.; Zhu, M. H.; Wang, X. G. Acta Phys.-Chim. Sin. 2007, 23, 198. (宋哲, 刘涛, 刘伟, 朱鸣华, 王晓刚, 物理化学学报, 2007, 23, 198.)
[16]
Morokuma, K.; Svensson, M.; Humbel, S. J. Phys. Chem. 1996, 100, 19357.
[17]
Xu, G. X.; Li, L. M.; Wang, D. M. Quantum Chemistry (Middle), Science Press, Beijing, 2009. (徐光宪, 黎乐民, 王德民, 量子化学(中册), 科学出版社, 北京, 2009.)
[18]
Jorgensen, W. L.; Maxwell, D. S.; TiradoRives, J. J. Am. Chem. Soc. 1996, 118, 11225.
[19]
http://openmopac.net/.
[20]
Dewar, M. J. S. J. Mol. Struct. 1983, 100, 41.
[21]
Van Der Spoel, D.; Lindahl, E.; Hess, B.; Groenhof, G.; Mark, A. E.; Berendsen, H. J. J. Comput. Chem. 2005, 26, 1701.
[22]
Hess, B.; Bekker, H.; Berendsen, H. J. C.; Fraaije, J. G. E. M. J. Comput. Chem. 1997, 18, 1463.
[23]
Bussi, G.; Donadio, D.; Parrinello, M. J. Chem. Phys. 2007, 126, 014101.
[24]
Parrinello, M.; Rahman, A. J. Appl. Phys. 1981, 52, 7182.
[25]
Nosé, S.; Klein, M. L. Mol. Phys. 1983, 50, 1055.
[26]
Darden, T.; York, D.; Pedersen, L. J. Chem. Phys. 1993, 98, 10089.
[27]
Essmann, U.; Perera, L.; Berkowitz, M. L.; Darden, T.; Lee, H.; Pedersen, L. G. J. Chem. Phys. 1995, 103, 8577.
[28]
Agudelo, W. A.; Galindo, J. F.; Patarroyo, M. E. Biochem. Biophys. Res. Commun. 2011, 410, 410.
[29]
Mulliken, R. S. J. Chem. Phys. 1955, 23, 1833.
[30]
Nicolas, R.; Ilka, H.; Ole, L.; Morten, N. Immunogenetics 2008, 60, 759.
[31]
Saper, M. A.; Bjorkman, P. J.; Wiley, D. C. J. Mol. Biol. 1991, 219, 277.
[32]
Lund, O.; Nielsen, M.; Kesmir, C.; Petersen, A. G.; Lundegaard, C. Immunogenetics 2004, 55, 797.
