(a) Rademaker-Lakhai, J. M.; van den Bongard, D.; Pluim, D.; Beijnen, J. H.; Schellens, J. H. Clin. Cancer Res. 2004, 10, 3717; (b) Hotze, A. C. G.; Bacac, M.; Velders, A. H.; Jansen, B. A. J.; Kooijman, H.; Spek, A. L.; Haasnoot, J. G.; Reedijk, J. J. Med. Chem. 2003, 46, 1743; (c) Alessio, E.; Mestroni, G.; Bergamo, A.; Sava, G. Curr. Top. Med. Chem. 2004, 4, 1525.
[5]
(a) Gao, J. Acc. Chem. Res. 1996, 29, 298; (b) Ishida, T.; Kato, S. J. Am. Chem. Soc. 2003, 125, 12035.
[6]
(a) Gao, J.; Freindorf, M. J. Phys. Chem. A 1997, 101, 3182; (b) Gao, J.; Xia, X. Science 1992, 258, 631.
[7]
Lee, C.; Yang, W.; Parr, R. G. Phys. Rev. B 1988, 37, 785.
[8]
(a) Hay, P. J.; Wadt, W. R. J. Chem. Phys. 1985, 82, 270; (b) Hay, P. J.; Wadt, W. R. J. Chem. Phys. 1985, 82, 299.
[9]
(a) Ditchfield, R.; Hehre, W. J.; Pople, J. A. J. Chem. Phys. 1971, 54, 724; (b) Hehre, W. J.; Ditchfield, R.; Pople, J. A. J. Chem. Phys. 1972, 56, 2257.
[10]
(a) Mennucci, B.; Cances, E.; Tomasi, J. J. Phys. Chem. B 1997, 101, 10506; (b) Mennucci, B.; Tomasi, J. J. Chem. Phys. 1997, 106, 5151.
[11]
(a) Kirkwood, J. G. J. Chem. Phys. 1935, 3, 300; (b) Zwanzig, R. W. J. Chem. Phys. 1954, 22, 1420; (c) Torrie, G. M.; Valleau, J. P. Chem. Phys. Lett. 1974, 28, 578.
[12]
(a) Derouane, E. G.; Fripiat, J. G.; Ballmoos, R. V. J. Phys. Chem. 1990, 94, 1687; (b) Wilson, M. S.; Ichikawa, S. J. Phys. Chem. 1989, 3087; (c) Husinaka, S.; Sakai, Y.; Miyoshi, E.; Narita, S. Chem. Phys. 1990, 93, 3319; (d) Jakalian, A.; Bush, B. L.; Jack, D. B.; Bayly, C. I. J. Comput. Chem. 2000, 21, 132.
[13]
Alessio, E.; Balducci, G.; Lutman, A.; Mestroni, G.; Calligaris, M.; Attia, W. M. Inorg. Chim. Acta 1993, 203, 205.
[14]
Warshel, A.; Levitt, M. J. Mol. Biol. 1976, 103, 227.
[15]
(a) Singh, U. C.; Kollman, P. A. J. Comput. Chem. 1986, 7, 718; (b) Field, M. J.; Bash, P. A.; Karplus, M. J. Comput. Chem. 1990, 11, 700; (c) Senn, H. M.; Thiel, W. Angew. Chem., Int. Ed. 2009, 48, 1198; (d) Rao, L.; Cui, Q.; Xu, X. J. Am. Chem. Soc. 2010, 132, 18092; (e) Mo, Y. R.; Alhambra, C.; Gao, J. L. Acta Chim. Sinica 2000, 58, 1504. (莫亦荣, Alhambra, C., 高加力, 化学学报, 2000, 58, 1504.); (f) Wei, K.; Liu, L.; Li, X. S.; Guo, Q. X. Chin. J. Chem. Phys. 2005, 18, 641. (魏凯, 刘磊, 李晓松, 郭庆祥, 化学物理学报, 2005, 18, 641.); (g) Ishida, T.; Kato, S. J. Am. Chem. Soc. 2003, 125, 12035, (h) Lin, H.; Truhlar, D. G. Theor. Chem. Acc. 2007, 117, 185; (i) Usharani, D.; Zazza, C.; Lai, W.; Chourasia, M.; Waskell, L.; Shaik, S. J. Am. Chem. Soc. 2012, 134, 4053; (j) Bernstein, N.; Várnai, C.; Solt, I.; Winfield, S. A.; Payne, M. C.; Simon, I.; Fuxreiter, M.; Csányi, G. Phys. Chem. Chem. Phys. 2012, 14, 646; (k) Azimi, S.; Rauk, A. J. Chem. Theory Comput. 2012, 8, 5150.
[16]
(a) Jorgensen, W. L.; Maxwell, D. S.; Tirado-Rives, J. J. Am. Chem. Soc. 1996, 118, 11225; (b) Jorgensen, W. L.; McDonald, N. A. Theochem. 1998, 424, 145.
[17]
(a) Weiner, P. K.; Kollman, P. A. J. Comput. Chem. 1981, 2, 287; (b) Case, D. A.; Cheatham, T.; Darden, T.; Gohlke, H.; Luo, R.; Merz, K. M.; Onufriev, A.; Simmerling, C.; Wang, B.; Woods, R. J. J. Comput. Chem. 2005, 26, 1668.
[18]
(a) MacKerell, A. D.; Bashford, D.; Dunbrack, R. L.; Evanseck, J. D.; Field, M. J.; Fischer, S.; Gao, J.; Guo, H.; Ha, S.; Joseph-McCarthy, D.; Kuchnir, L.; Kuczera, K.; Lau, F. T. K.; Mattos, C.; Michnick, S.; Ngo, T.; Nguyen, D. T.; Prodhom, B.; Reiher, W. E.; Roux, B.; Schlenkrich, M.; Smith, J. C.; Stote, R.; Straub, J.; Watanabe, M.; Wiórkiewicz-Kuczera, J.; Yin, D.; Karplus, M. J. Phys. Chem. B 1998, 102, 3586; (b) Brooks, B. R.; Brooks, C. L.; Mackerell, A. D.; Nilsson, L.; Petrella, R. J.; Roux, B.; Won, Y.; Archontis, G.; Bartels, C.; Boresch, S.; Caflisch, A.; Caves, L.; Cui, Q.; Dinner, A. R.; Feig, M.; Fischer, S.; Gao, J.; Hodoscek, M.; Im, W.; Kuczera, K.; Lazaridis, T.; Ma, J.; Ovchinnikov, V.; Paci, E.; Pastor, R. W.; Post, C. B.; Pu, J. Z.; Schaefer, M.; Tidor, B.; Venable, R. M.; Woodcock, H. L.; Wu, X.; Yang, W.; York, D. M.; Karplus, M. J. Comput. Chem. 2009, 30, 1545.
[19]
(a) Yang, Z. Z.; Wang, C. S. J. Phys. Chem. A 1997, 101, 6315; (b) Yang, Z. Z.; Wang, C. S. J. Chem. Theory Comput. 2003, 2, 273; (c) Cong, Y.; Yang, Z. Z. Chem. Phys. Lett. 2000, 316, 324.
[20]
Mortier, W. J.; Ghosh, S. K.; Shankar, S. J. Am. Chem. Soc. 1986, 108, 4315.
[21]
(a) Zhao, D. X.; Liu, C.; Wang, F. F.; Yu, C. Y.; Gong, L. D.; Liu, S. B.; Yang, Z. Z. J. Chem. Theory Comput. 2010, 6, 795; (b) Yang, Z. Z.; Wu, Y.; Zhao, D. X. J. Chem. Phys. 2004, 120, 2541.
[22]
(a) Wu, Y.; Yang, Z. Z. J. Phys. Chem. A 2004, 108, 7563; (b) Li, X.; Yang, Z. Z. J. Phys. Chem. A 2005, 109, 4102.
