OALib Journal期刊
一株海洋金藻的18S rRNA 基因序列分析及分类
, PP. 53-57
Keywords: Isochrysis ,sp. ,strain ,HG ,鉴定 ,18S ,rDNA ,系统发育分析
Abstract:
Isochrysissp.strainHG是一株分离自福建长乐自然海区的金藻,是一种良好的西施舌育苗饵料藻。显微形态观察表明,Isochrysissp.strainHG的形态特性与等鞭金藻属的球等鞭金藻(I.galbana)和湛江等鞭金藻(I.zhanjiangensis)比较接近。进一步克隆Isochrysissp.strainHG的核糖体小亚基(smallsubunit,SSU)18SrRNA基因,获得了长度为1780bp的基因序列。同源性分析表明,该序列与在NCBI数据库中登录的等鞭金藻属的18SrRNA基因序列同源性最高,说明结果与形态鉴定的结果相一致。基于18SrRNA基因序列的系统发育分析表明,Isochrysissp.strainHG与等鞭金藻属的I.zhangjiangensis、Isochrysissp.strainCCAP927/14、I.galbana和Isochrysissp.strainSantou聚在一个分支类群上,其中I.zhangjiangensis与Isochrysissp.strainCCAP927/14聚为一个独立的子类群,和I.galbana、Isochrysissp.strainSantou以及目标菌株Isochrysissp.strainHG形成4个并列独立的分支。根据形态及分子系统分析结果,Isochrysissp.strainHG可能是不同于I.zhangjiangensis、I.galbana的等鞭金藻种类。
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