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ISSN: 2333-9721
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海洋科学  2014 

裂殖壶菌OUC88 及10 个派生菌株18S rDNA 基因克隆和分析

DOI: 10.11759/hykx20130112003, PP. 71-78

Keywords: 裂殖壶菌OUC88,18S,rDNA,基因克隆,序列比对分析,进化树

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Abstract:

用PCR方法从裂殖壶菌SchizochytriumlimacinumOUC88及以其为出发菌株经紫外诱变筛选的10个菌株中扩增出18SrDNA基因序列(1751bp到1758bp)进行序列测定,以上序列已登录GenBank(HM042904-HM042914)并与已登录的裂殖壶菌属5条18SrDNA序列比对分析。结果表明,S.limacinumOUC88以及10个派生菌株间18SrDNA的遗传距离是0.000~0.013,与Schizochytriumsp.FJU-51218SrDNA(GenBankNo.AY758384)的同源性最高,为98%~99%;与S.limacinum(GenBankNo.AB022107)的同源性为96%;与同属异种S.mangrovei(GenBankNo.DQ100293)只有93%的同源性。并运用序列比对分析和MEGA4.0系统进化树,结果显示种内诱变产生的细微变异小于同属内不同物种之间的变异。本研究除了为裂殖壶菌这种重要的经济海洋真菌提供分子生物学资料以外,同时表明18SrDNA序列不仅在分子分类上是一个重要的标志,也可分析由突变引起的物种内细微的遗传变异。

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