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ISSN: 2333-9721
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海洋科学  2012 

波纹唇鱼微卫星分子标记的筛选及适用性分析

, PP. 109-116

Keywords: 波纹唇鱼(Cheilinus,undulatus),微卫星分子标记,筛选,磁珠富集法

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Abstract:

采用磁珠富集法及利用生物素标记的(CA)15寡核苷酸探针从波纹唇鱼(Cheilinusundulatus)基因组DNABsp143Ⅰ酶切位点的400~1000bp片段中筛选CA/GT微卫星位点。洗脱的杂交片段克隆到PMD18-T载体上构建富集微卫星基因组文库后,通过PCR筛选出阳性克隆进行测序。在120条序列中有88条序列包含有重复次数不少于5次的微卫星位点,阳性序列比例达到73.33%。其中完美型(perfect)类型微卫星最多的重复次数为26次。在88条非冗长序列中,共有28条(31.82%)微卫星重复序列两端有侧翼序列能够进行引物设计。用波纹唇鱼3个个体的混合基因进行引物筛选,其中的24对具有清晰的扩增条带。将筛选的24对引物对波纹唇鱼1个群体的39个个体进行遗传多样性分析,其中4对引物扩增产物为单态,20对扩增产物呈多态性;20对扩增多态的引物在39个个体中扩增出等位基因数为2~12,平均有效等位基因数为3.5。该波纹唇鱼群体的PIC、Ho、He的平均值分别为0.0782、0.8513、0.5667。这20个微卫星位点适于波纹唇鱼群体遗传结构的研究分析。

References

[1]  孙效文;贾智英;魏东旺.磁珠富集法与小片段克隆法筛选鲤微卫星的比较研究[J].中国水产科学,2005(2)
[2]  Botsein D;White R L;Skolnick M Construction of a genetic linkage map in man using restriction frag-ment length polymorphisms 1980(3)
[3]  Brenner S;Elgar G;Sandford R Characterization of the pufferfish (Fugu) genome as a compact model vertebrate genome 1993
[4]  Toth G;Gaspari Z;Jurka J Microsatellites in different eukaryotic genomes:survey and analysis 2000
[5]  魏东旺;楼允东;孙效文.鲤鱼微卫星分子标记的筛选[J].动物学研究,2001(3)
[6]  李霞;白俊杰;吴淑勤.剑尾鱼微卫星DNA的筛选[J].中国水产科学,2004(3)
[7]  刘丽;刘楚吾;郭昱嵩.青石斑鱼微卫星DNA标记的筛选及群体遗传多样性分析[J].中国水产科学,2008(1)
[8]  郭昱嵩;王中铎;刘楚吾.勒氏笛鲷微卫星位点的筛选及特征分析[J].遗传,2007(3)
[9]  李绍戊;常玉梅;梁利群.团头鲂微卫星标记的快速制备[J].中国水产科学,2006(2)
[10]  Ellegren H Microsatellite evolutin:a battle between replication slippage and point mutation 2002
[11]  龚小玲;李思发;蔡完其.澳洲鳗鲡微卫星分子标记的筛选与检测[J].中国水产科学,2009(1)
[12]  沈世杰 台湾鱼类志 1993
[13]  世界自然基金会 十大濒临灭绝生物名单 2005
[14]  Russell B The IUCN Red List of Threatened Spe1 ties(2004) 2012
[15]  Sadovy Y IUCN RedList(2000) 2012
[16]  伍汉霖 有毒、药用及危险鱼类图鉴 2005
[17]  于宏;雷霁霖;陈超 波纹唇体生物学特性及繁育保护初步研究 2008
[18]  区又君;齐旭东;李加儿.波纹唇鱼不同组织5种同工酶表达的差异[J].南方水产,2009(2)doi:10.3969/j.issn.1673-2227.2009.02.009
[19]  霍蕊;张本;陈国华.波纹唇鱼染色体核型分析[J].海洋科学,2009(4)
[20]  周丽青;杨爱国;吴彪.波纹唇鱼染色体制备及核型的初步研究[J].渔业科学进展,2010(1)doi:10.3969/j.issn.1000-7075.2010.01.009
[21]  Sluka R D Grouper and Napoleon wrasse ecology in Laamu Atoll,Republic of Maldives:Part II.Habitat,behavior,and movement patterns 2000
[22]  Sluka R D Humphead Wrasse (Cheilinus undulatus) abundance and size structure among coral reef habitats in maldives 2005
[23]  Donaldson T J;Sadovy Y Threatened fishes of the world:Cheilinus undulatus RUppell,1835 (Labri-dae) 2001
[24]  Sadovy Y;Kulbicki M;Labrosse P The humphead wrasse,Cheilinus undulatus:synopsis of a threatened and poorly known giant coral reef fish 2003
[25]  Choat J H;Davies C R;Ackerman J L Age struc-ture and growth in a large teleost,Cheilinus undulatus,with a review of size distribution in labrid fishes 2006
[26]  Dorenbosch M;Grol M C;Nagelkerken I Sea-grass beds and mangroves as potential nurseries for the threatened Indo-Pacific humphead wrasse,Cheilinus undulatus and Caribbean rainbow parrotfish,Scarus guacamaia 2006
[27]  Wright J M;Bentzen P Microsatellites:genetic markers for the future 1994
[28]  胡则辉;周志刚.微卫星DNA标记技术及其在海洋生物遗传学中的应用[J].海洋湖沼通报,2006(4)doi:10.3969/j.issn.1003-6482.2006.01.005
[29]  尹绍武;黄海;雷从改.DNA分子标记技术在海水鱼类遗传育种中的应用与展望[J].海南大学学报(自然科学版),2007(2)doi:10.3969/j.issn.1004-1729.2007.02.021
[30]  张小谷;童金苟;熊邦喜.微卫星标记在鱼类遗传及育种研究中的应用[J].农业生物技术学报,2006(1)doi:10.3969/j.issn.1674-7968.2006.01.023
[31]  Rivera M J;Graham G C;Roderick G K Isolation and characterization of nine microsatellite loci from the Hawaiian grouper Epinephelus quernus (Serranidae) for population genetic analyses 2003
[32]  Zatcoff M S;Ball A O;Sedberry G R Population ge-netic analysis of red grouper,Epinephelus morio,and scamp,Myceroperca phenax,from the southeastern U.S.Atlantic and Gulf of Mexico 2004
[33]  Wang C M;Zhu Z Y;Na-Nakom U;Koedprang W Study of genetic diversity of orange-spotted grouper,Epinephelus coioides,from Thailand and Indonesia us-ing microsatellite markers 2005
[34]  Chun Ming Wang;Ze Yuan Zhu;Loong Chueng Lo A microsatellite linkage map of barramundi,Lates calcarifer 2007
[35]  Moghadam H K;Poissant J;Fotherby H Quanti-tative trait loci for body weight,condition factor and age at sexual maturation in arctic charr (Salvelinus alpinus):comparative analysis with rainbow trout (On-corhynchus mykiss) and Atlantic salmon (Salmo salar) 2007(6)
[36]  萨姆布鲁克·J;弗里奇EF3;曼尼阿蒂斯T 分子克隆实验指南 1995
[37]  Weber J L Informativeness of human (dC-dA)n-(dG-dT)n pol morohisms 1990
[38]  Sanguinetti C L;Dias Neto E S A Rapid silver staining and reeovery of PCR products separated on polyaeryla-mide gels 1994
[39]  曾庆国;陈艺燕.微卫星位点筛选方法综述[J].生态科学,2005(4)doi:10.3969/j.issn.1008-8873.2005.04.020
[40]  胡维;向华;周艳.用PCR法直接快速筛查重组阳性克隆[J].生物技术通报,1999(6)doi:10.3969/j.issn.1002-5464.1999.06.008
[41]  徐鹏;周岭华;相建海.用PCR法快速筛选中国对虾含微卫星的重组阳性克隆[J].水产学报,2001(2)
[42]  宋春妮;李健;刘萍.日本鲟微卫星富集文库的建立与多态性标记的筛选[J].水产学报,2011(1)doi:10.3724/SP.J.1231.2011.17156

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