全部 标题 作者
关键词 摘要

OALib Journal期刊
ISSN: 2333-9721
费用:99美元

查看量下载量

相关文章

更多...
海洋科学  2009 

海湾扇贝微卫星标记开发及其分离方式分析

, PP. 4-8

Keywords: 海湾扇贝(Argopecten,irradians),微卫星,富集文库,无效等位基因,分离方式

Full-Text   Cite this paper   Add to My Lib

Abstract:

利用尼龙膜吸附杂交法构建了海湾扇贝的(AC)15、(AG)15微卫星富集文库,随机挑取3000个克隆,经菌落原位杂交二次筛选共获得阳性克隆1268个(42.3%)。经序列测定和生物信息学分析后得到521个独立的阳性克隆,其中微卫星506个,小卫星15个。微卫星中,完美型248个,占总数的49.0%;非完美型216个,占42.7%;复合型42个,占8.3%;其中AG/TC重复占70.4%(356个),AC/TG重复29.6%(150个)。选择其中的55条序列设计引物,筛选出其中的20对引物检测它们在海湾扇贝CC10家系的双亲和94个子代个体中的分离情况,结果表明:(1)其中6个位点在母本和子代中发生分离,10个位点在父本和子代中发生分离,4个为双亲共享位点;(2)2个位点存在无效等位基因;(3)16个位点符合孟德尔遗传定律,4个位点的子代个体基因型频率偏离孟德尔遗传定律。上述结果表明,这些微卫星引物可以用于构建海湾扇贝的遗传连锁图谱,并且所构建的富集文库适用于微卫星标记的大规模开发。

References

[1]  张福绥,海湾扇贝引进中国10周年,齐鲁渔业,1993(5).
[2]  张福绥.何义朝.杨红生 海湾扇贝引种工程及其综合效应 [J].-中国工程科学2000(2)
[3]  刘晓.孙博.张国范.王春德.章又荣.谷震.张福绥 海湾扇贝4次引种后代的表型特征和遗传分化 [J].-海洋与湖沼2006(1)
[4]  Tautz D,Hypervariality of simple sequences as a general source for polymorphic DNA markers,Nucleic Acids Research,1989(16).
[5]  李琪 海洋贝类微卫星DNA标记的开发及其在遗传学研究中的应用 [J].-中国水产科学2006(3)
[6]  王伟.尤锋.高天翔.张培军 鱼类微卫星标记的研究进展 [J].-海洋科学2006(10)
[7]  胡景杰.战爱斌.胡晓丽.陆维.黄晓婷.包振民 几种养殖扇贝微卫星标记的研究进展 [J].-水产学报2009(2)
[8]  Hubert S,Hedgecock D,Linkage maps of microsatellite DNA markers for the Pacific oyster Crassostrea gigas,Genetics,2004.
[9]  Roberts S,Romano C,Gerlach G,Characterization of EST derived SSRs from the bay scallop,Argopecten irradians,Molecular Ecology Notes,2005.
[10]  Zhan A B,Bao Z M,Wang X L,Microsatellite markers derived from bay scallop (Argopecten irradians) expressed sequence tags,Fisheries Sciences,2005(6).
[11]  Wang L L,Song L S,Xu W,Screening microsatellite markers from EST sequences of bay scallop Argopecten irradians,High Technology Letters,2006(1).
[12]  Zhan A B,Hu J J,Wang X L,A panel of polymorphic EST-derived microsatellite loci for the bay scallop (Argopecten irradians),Journal of Molluscan Studies,2006(4).
[13]  Li H J,Liu X,H J J,A set of polymorphic microsatellite loci for the bay scallop,Argopecten irradians,Molecular Ecology Notes,2007.
[14]  战爱斌.胡景杰.胡晓丽.王明玲.彭薇.李艳.李纪勤.包振民 富集文库─菌落原位杂交法筛选栉孔扇贝的微卫星标记 [J].-水产学报2008(3)
[15]  Weber J L,Informativeness of human (dC-dA)n.(dG-dT)n polymorphisms,Genomics,1990(4).
[16]  Reece K S,Ribeiro W L,Gaffney P M,Microsatellite marker development and analysis in the eastern oyster (Crassostrea virginica):confirmation of null alleles and non-Mendelian segregation ratios,Journal of Heredity,2004(4).

Full-Text

Contact Us

service@oalib.com

QQ:3279437679

WhatsApp +8615387084133