河流沉积物中微生物DNA的提取方法比较研究

提取河流沉积物中DNA是研究河流沉积物微生物多样性的难点之一，实验开发了一种酚与SDS的DNA提取方法，与OMEGA和BioDee2种DNA提取试剂盒方法进行了比较，并通过DNA纯度、PCR扩增结合16SrDNA克隆文库检验对几种方法进行了评价。结果表明,OMEGADNA提取试剂盒法方法简单，提取的DNA纯度较高，酚+SDS法用时较长,DNA提取量大，纯度较低。BioDee试剂盒提取量最小，虽然对PCR结果没有影响，但不能满足沉积物微生物多样性分析的要求。OMEGADNA提取试剂盒法和酚+SDS法可分别用于PCR扩增、克隆文库、DGGE等的后续实验。