茄子微卫星标记(SSR)反应体系的优化研究

以茄子品种“哈农杂茄4号”DNA为试材，利用单因素试验方法，研究了茄子SSR技术中PCR体系的主要成分对SSR扩增结果的影响，并比较了聚丙烯酰胺凝胶和琼脂糖电泳检测扩增产物多态性的差异。结果表明反应体系中，模板DNA的适宜浓度为20~40ng，适宜的引物浓度为0.3μmol/L，dNTP的适宜浓度为200μmol/L，Mg2+的最适浓度范围为2.0~2.5mmol/L，？Taq？聚合酶在20μL反应体系中宜加入1U。茄子SSR的最佳反应程序为94℃预变性5min；94℃变性1min，52~56℃复性1min，72℃延伸2min，35个循环;最后72℃延伸8min。PCR产物检测时6%的聚丙烯酰胺凝胶的分辨率显著高于1.8%的琼脂糖电泳。