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北方园艺 2015
加工番茄PCR-SSCP分子标记体系的建立与优化DOI: 10.11937/bfyy.201515024, PP. 88-91 Keywords: 加工番茄,PCR-SSCP,聚丙烯酰胺凝胶,银染 Abstract: 以加工番茄为试验材料,采用PCR-SSCP分子标记技术,对DNA提取方法、PCR反应程序、聚合酶链式反应-单链构象多态性分子标记体系的电泳条件、变性剂等诸多因素进行了研究,筛选和建立了多态性检出率高、带型清晰、重复性好的PCR-SSCP反应体系和反应程序。结果表明采用CTAB法提取番茄叶片DNA时,在CTAB缓冲液中加入5mol/LNaCl,第一次抽提离心速度和离心时间分别为8000r/min和15min,可以获得高质量的DNA,PCR扩增程序为94℃5min,94℃1min,52℃30s,72℃1min,72℃10min,29个循环,退火温度52℃,引物大小100~300bp、98℃变性10min,非变性聚丙烯酰胺凝胶浓度8%,电泳1.5~2.5h,聚丙烯酰胺凝胶中不添加甘油为加工番茄PCR-SSCP分子标记体系最佳的条件组合。?
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