甜瓜基因组SSR位点分布规律与多态性初探

以3个甜瓜品种“BM7”、“伽师瓜”和“Y8”为试材，选取甜瓜基因组的3个DNA区域进行SSR位点的分布规律分析，进一步通过聚丙烯酰胺凝胶电泳检验甜瓜基因组SSR位点的多态性，以期初步揭示甜瓜基因组中SSR位点的分布规律及其多态性，进而为甜瓜及其它物种开展相关研究提供参考。试验表明甜瓜基因组中平均每1.9kb就有一个SSR位点，富含A和T的重复基序出现的频率远高于富含C和G的重复基序的频率，没有发现全部由C、G构成的重复基序；二、三、四碱基重复基序的SSR位点占绝大多数(83.3%)，五、六碱基重复基序的SSR位点分布较少(16.7%)。二、三、四、五、六核苷酸重复基序SSR位点平均长度依次为21、15、14、16、20bp。设计的82对SSR引物中81对扩增出产物，多态比例最高为48.1%。试验表明，甜瓜基因组中SSR分布具有一定规律，并且可以利用SSR分子标记开展相关研究;试验同时对更好地开展SSR和ISSR分子标记的相关研究奠定了理论基础和依据。