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ISSN: 2333-9721
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一种采用知识打分函数的分子对接方法

DOI: 10.7511/dllgxb201002001, PP. 157-161

Keywords: 分子对接,知识打分函数,遗传算法,优化模型

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Abstract:

分子对接是计算机辅助药物分子优化设计的重要组成部分.引入了一种通过计算原子对间距离来评价结合自由能的知识打分函数,其构造方法与平均力势能函数相似.同时采用基于信息熵的多种群自适应遗传算法,形成一种新型的分子对接程序KGAsDock.给出与著名的分子对接程序DOCK6.1的对接结果比较,数值实验表明,该算法在不降低计算效率的前提下,提高了对接的精度.

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