草鱼EST-SSR标记及5个不同地域群体的遗传结构分析

以草鱼(Ctenopharyngodonidella)脑、肌肉、肝等组织构建cDNA文库,经测序获得unigenes序列45318个,从中筛选微卫星序列共5556个,据此设计EST-SSR引物118对,其中19对引物能够扩增出带型清晰且多态性较高的谱带。用这19个EST-SSR标记研究3个长江水系群体(石首、监利和长沙)和2个珠江水系群体(清远和肇庆)草鱼的遗传结构。结果表明,5个群体的平均多态信息含量(PIC)为0.4154~0.4604,显示草鱼群体的遗传多样性偏低;平均观测杂合度(Ho)为0.4158~0.5013,平均期望杂合度为(He)0.4506~0.5028,其中,长沙群体平均期望杂合度最高,为0.5028,监利群体的平均观察杂合度和平均期望杂合度均最低,分别为0.4158和0.4506,即长沙群体的遗传多样性最高,监利群体的遗传多样性最低;对数据进行F-检验,结果表明,群体间的遗传分化程度低。Hardy-Weinberg平衡的卡方检验结果表明,5个群体均一定程度上偏离了平衡;聚类分析显示长沙群体、石首群体与监利群体聚成一支;肇庆群体与清远群体聚成一支,这与草鱼群体的流域分布一致。