吉富罗非鱼两种生长激素受体基因的分离及与增重相关的SNPs位点

实验分离了吉富罗非鱼(Oreochromisniloticus)两种生长激素受体基因GHR1和GHR2的全长cDNA以及GHR1阅读框中外显子2~9、GHR2阅读框外显子2~8的DNA序列。在GHR1和GHR2分别找到6个和16个SNPs位点,其中只有2个位点在外显子部分。使用PCR-RFLP方法检测了5个家系共120尾吉富罗非鱼在8个SNPs(GHR1内含子3_A612G、内含子3_A989T、内含子7_A599C;GHR2内含子3_C330T、内含子3_A645G、内含子3_G687T、内含子3_A967G、内含子7_C107T)的基因型。不同基因型与雌、雄吉富罗非鱼增重的相关性分析显示,GHR1内含子3_A612G及内含子3_A989T与雄鱼增重极显著(P<0.01)和显著(P<0.05)相关,杂合型个体增重最大,在雌鱼群体中有类似趋势,但差异不显著;内含子7_A599C与雄鱼、雌鱼增重分别呈现极显著(P<0.01)和显著(P<0.05)相关,CC型雌雄鱼增重均大于AA型;GHR2上只有内含子3_G687T与雌鱼增重显著相关(P<0.05),GT型个体增重显著大于GG型。检测了60个家系共356尾吉富罗非鱼在3_A612G、3_A989T、7_A599C和3_G687T的基因型与增重性状的相关性,结果具有相同趋势,因样本少、遗传背景多样,导致差异性显著降低。实时定量PCR结果显示,GHR1在雄鱼肝的表达量是雌鱼的1.36倍;除肾外,GHR2在雄鱼各组织的表达量均低于雌鱼,这部分解释了GHR1和GHR2基因上SNP位点对雌、雄吉富罗非鱼增重的不同影响。此外,GHR1、GHR2对生长影响程度的不同,导致只在GHR2上找到1个SNP位点对增重有影响。