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ISSN: 2333-9721
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齿缘摄龟线粒体基因组全序列与系统进化

DOI: 10.13859/j.cjz.201404010, PP. 536-545

Keywords: 齿缘摄龟,线粒体全基因组,系统进化关系

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Abstract:

采用常规PCR扩增并测序获得了齿缘摄龟线粒体DNA(mtDNA)全序列,并研究了其基因组结构特点;根据20种龟的线粒体基因组重链蛋白编码基因序列,分别利用最大简约法(MP)、最大似然法(ML)和贝叶斯法(Bayesian)构建系统进化树,探讨这些龟鳖物种之间的系统进化关系。结果显示:齿缘摄龟线粒体基因组全序列长为16489bp,GenBank登录号为JX455823;AT含量为61.51%,编码37个基因,包括13个蛋白质编码基因,2个rRNA,22个tRNA和1个控制区(D-loop),基因组成与其它龟鳖类动物相似;非编码区D-Loop长973bp,包含1个中央保守区(CD),2个扩展终止结合序列区(ETASs),3个保守盒(CSBs);构建的MP树、ML树和Bayesian树的拓扑结构相似,闭壳龟属7种龟聚为一枝,拟水龟属6种龟聚为一枝,齿缘摄龟与黑桥摄龟聚在一枝,3种进化树均支持这些龟鳖物种现有的分类学地位。

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