哺乳动物BMP4蛋白功能位点的进化踪迹分析

摘要：哺乳动物骨形态发生蛋白（BMPs）具有促进动物软骨形成、调节细胞增殖、分化及迁移的多种功能。此外，在动物个体发育及人肿瘤的发生、发展过程中都扮演着重要角色。本文以人（Homo sapiens）源骨形态发生蛋白4（BMP4）蛋白为种子序列，利用多种生物信息学工具进行哺乳动物BMP4蛋白的序列查找及其同源蛋白的搜索，共得到具有完整结构域的同源蛋白序列72条，并以此为基础对哺乳动物BMP4的进化踪迹位点及相关的功能位点进行了比较研究。结果表明，BMP4蛋白家族的TGF?-propeptide结构域具22个全家族保守残基，而TGF-?结构域仅具84个亚家族特异性残基。人BMP4蛋白TGF-?结构域的配基结合位点主要分布于结合口袋的边缘区域。本研究为BMP4蛋白重要功能区残基的确定及未知功能位点的预测提供了重要信息