全部 标题 作者
关键词 摘要

OALib Journal期刊
ISSN: 2333-9721
费用:99美元

查看量下载量

相关文章

更多...
分析化学  2014 

创新数据非依赖性采集用于复杂基质目标蛋白质的定量分析

DOI: 10.11895/j.issn.0253-3820.140365, PP. 1750-1758

Keywords: 静电场轨道阱,数据非依赖性采集,蛋白质组学,绝对定量

Full-Text   Cite this paper   Add to My Lib

Abstract:

数据非依赖性采集(DIA)是随着定量蛋白质组学而建立的质谱扫描技术.DIA能够获得扫描范围内所有母离子及二级子离子信息,不会造成低丰度离子信息的丢失,同时突破了高分辨质谱二级定量的通量限制.本研究基于静电场轨道阱Q-qIT-OT三合一质谱,发展了经典DIA方法以及WiSIM-DIA和FullMS-DIA两种全新DIA方法,并对Hela细胞全蛋白中添加的10条低浓度肽段进行定量分析,考察方法的线性、重现性和灵敏度.结果表明,3种方法的定量限均低至amol(14~435amol),并展示出良好的线性和定性确证可靠性.其中,WiSIM-DIA基于超高分辨一级监测定量,与经典DIA优势互补;FullMS-DIA的选择窗口仅3amu,能够直接进行搜库鉴定,实现了数据依赖性采集(DDA)和DIA的统一,摆脱了DIA依赖于DDA建立谱图库的局限性.

References

[1]  1 Kalli A, Smith G T, Sweredoski M J, Hess S. J. Proteome Res., 2013, 12(7):3071-3086
[2]  5 Gallien S, Duriez E, Demeure K, Domon B. J. Proteomics, 2013, 81:148-158
[3]  6 Chapman J D, Goodlett D R, Masselon C D. Mass Spectrom. Rev., 2013:10.1002/mas.21400
[4]  7 Law K P, Lim Y P. Expert Rev. Proteomics, 2013, 10(6):551-566
[5]  8 Gillet L C, Navarro P, Tate S, Rost H, Selevsek N, Reiter L, Bonner R, Aebersold R. Mol. Cell. Proteomics, 2012, 11(6):O111.016717
[6]  10 Senko M W, Remes P M, Canterbury J D, Mathur R, Song Q, Eliuk S M, Mullen C, Earley L, Hardman M, Blethrow J D, Bui H, Specht A, Lange O, Denisov E, Makarov A, Horning S, Zabrouskov V. Anal. Chem., 2013, 85(24):11710-11714
[7]  2 Nagaraj N, Kulak N A, Cox J, Neuhauser N, Mayr K, Hoerning O, Vorm O, Mann M. Mol. Cell. Proteomics, 2012, 11(3):M111.013722
[8]  3 Geiger T, Wehner A, Schaab C, Cox J, Mann M. Mol. Cell. Proteomics, 2012, 11(3):M111.014050
[9]  4 Gallien S, Duriez E, Crone C, Kellmann M, Moehring T, Domon B. Mol. Cell. Proteomics, 2012, 11(12):1709-1723
[10]  9 Egertson J D, Kuehn A, Merrihew G E, Bateman N W, MacLean B X, Ting Y S, Canterbury J D, Marsh D M, Kellmann M, Zabrouskov V, Wu C C, MacCoss M J. Nat. Methods, 2013, 10(8):744-746

Full-Text

Contact Us

service@oalib.com

QQ:3279437679

WhatsApp +8615387084133