抗原特异TCRα和β链基因克隆及分子空间结构预测

目的扩增弥漫大B细胞淋巴瘤（diffuselargeBcelllymphoma，DLBCL）相关抗原特异T细胞克隆的全长TCRα和β链基因序列，并对其三维空间结构进行预测。方法从已鉴定的2例伴有克隆性增殖TCRVα6和Vβ13亚家族T细胞的DLBCL患者外周血中克隆全长TCRα和β基因序列，利用PrimerPremier5.0分析软件推算其相应的氨基酸序列，并通过自动化蛋白质模建服务器SWISS-MODEL进行三维空间结构预测。然后利用蛋白质三维图像分析软件Rasmol对所获得的TCR三维空间结构进行显示和分析。结果获得DLBCL相关抗原特异TCRα6和β13全长基因序列及其氨基酸序列。2例患者的TCRVα6的空间结构与PDBID:3ffcD模型相似，序列同源性分别为92.16%和91.71%；而2个TCRVβ13也均具有同一个空间结构模型PDBID:2ialD，序列同源性分别为92.95%和92.18%。结论来自不同DLBCL患者外周血中克隆性增殖的TCRVα6或Vβ13亚家族T细胞的TCR具有高度同源性的空间结构，提示其可能识别相同的肿瘤抗原表位。