四川黑熊线粒体细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ基因的克隆及序列分析

目的探讨四川黑熊线粒体细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ基因的特征。方法根据已经报道的细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ(cytochromecoxidasesubunitⅠ,COXⅠ)基因设计引物、PCR扩增和直接测序，并用软件对四川黑熊及其他几个物种的COXⅠ基因序列及COXⅠ蛋白的氨基酸序列进行了分析。结果四川黑熊COXⅠ基因长1605bp，编码含514个氨基酸残基的前体蛋白。碱基的含量分别为：A:26.9%,C:23.1%,G:18.3%,T:31.8%。起始密码子为“ATG”，终止密码子为“TAA”。蛋白质等电点为6.29，分子质量为57.2×103。以四川黑熊和已报道的其他6种动物的COXⅠ基因序列为数据构建的分子系统发育树表明在所比较的其他3种熊类中，四川黑熊和美洲黑熊的亲缘关系最近；在牛，狗和大鼠中，四川黑熊与狗的亲缘关系最近。结论四川黑熊COXⅠ基因的DNA序列和蛋白的氨基酸序列和其他动物的相应序列有很高相似性，表明COX基因在所比较的几个物种中具有高度保守性。