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ISSN: 2333-9721
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鲍曼不动杆菌噬菌体AB3的全基因组测序及生物信息学分析

, PP. 1562-1565

Keywords: 鲍曼不动杆菌,噬菌体,基因组,生物信息学

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Abstract:

目的对本研究小组分离的鲍曼不动杆菌噬菌体AB3进行测序和基因组生物信息学分析,阐明其亲缘关系。方法采用鸟枪法和重叠群组装的策略对噬菌体AB3进行基因组测序,并通过EditSeq、tRNAscan-SE、TRF、FindTerm、ORFfinder、BPROM、GeneMarkTM、Clustalx、phylip等软件对所获噬菌体AB3基因组的一般特性、编码基因的功能预测、RNA聚合酶基因系统的进化进行分析。结果噬菌体AB3基因组为全长31185bp的双链DNA,G+C含量为39.18%,包含28个预测基因,1个转录终止子和4个可能的启动子序列。结论基因分析和RNA聚合酶基因进化分析显示噬菌体AB3与噬菌体AB1类似,均属于phiKMV-like病毒属。

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