五种鲟鱼线粒体控制区异质性和系统发育分析

利用保守引物得到五种鲟鱼的线粒体DNA（mtDNA）控制区（D-loop）全长，长度在795~813bp。序列中包括了CBS（conservedsequenceblock）和TAS（termination-associatedsequence）区域。利用最大似然法、最大简约法和贝叶斯法构建了系统发育树，发育树分成两枝，呈现明显的生物地理分布。分析表明，现有的鳇属鱼类不是单系群起源。五种鲟鱼D-loop序列都存在长度和数目不等串联重复序列，长度在78~82bp之间，重复序列拷贝数在4~6次不等，因此造成了mtDNA广泛的异质性现象。不同种类的重复序列单元十分相似，达氏鳇和史氏鲟重复序列单元相似度为82.93%，西伯利亚鲟和俄罗斯鲟重复序列单元相似度为90.59%。在串联重复序列后是一段不完全重复序列。通过与已有同种的重复序列比对发现不同鲟鱼重复序列相同，不同地理区域相同物种的重复序列可能发生过分子内重组。这些表明重复序列在鲟鱼进化上具有相关意义，推测重复序列可能产生在种分化前，重组发生在种分化后。