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ISSN: 2333-9721
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嗜热四膜虫腺苷三磷酸结合盒转运蛋白ABCC10基因的可变剪切分析

DOI: 10.3724/SP.J.1141.201106605, PP. 605-610

Keywords: 嗜热四膜虫,ABC转运蛋白,可变剪切,实时荧光定量PCR,NMD

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Abstract:

哺乳动物中腺苷三磷酸结合盒转运蛋白(ATP-bindingcassettetransporter,ABCT)可通过可变剪切产生多种转录本,其中含有提前终止密码子(prematureterminalcodon,PTC)的转录本还可与无义介导的mRNA降解通路(nonsense-mediatedmRNAdecay,NMD)作用来调节蛋白的相关功能,但这些现象尚未在低等生物的ABCT研究中发现。该文以单细胞原生动物——嗜热四膜虫为对象,利用转录组数据发现ABCC10基因存在可变剪切,并产生两条转录本(SV1和SV2),其中SV2在第五个内含子处发生内含子保留事件,这段长49bp的序列使SV2发生移码并产生PTC。在构建NMD通路中关键因子UPF1基因的嗜热四膜虫敲降株的基础上,利用实时荧光定量PCR方法检测SV2的转录情况。结果显示:含有PTC的转录本SV2在UPF1敲降株中的转录水平相对于野生型显著增加,说明SV2可被NMD通路降解。这与高等动物中某些ABCC蛋白通过可变剪切引入含PTC转录本,并能被NMD降解的方式一致,推测该方式在真核生物中十分保守,并在真核生物的共同祖先(thelasteukaryoticcommonancestor)中就已形成。

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