DNA水平自然选择作用的检测

上个世纪60年代，Kimura提出的“中性进化”假说使经典的达尔文自然选择学说遭遇了前所未有的挑战。但新近的研究表明：在DNA水平，越来越多的证据支持“自然选择”的进化理论。这些研究成果得益于近年来大量群体和基因组DNA数据的积累，以及理论群体遗传学的发展。在DNA水平检测选择作用是否存在的方法包括两大类：种内多态性检验和种间差异度检验。前者以Tajima(1989)提出的D检验为代表，后者大都基于“中性条件下，种内与种间进化速率一致”的原理。这些方法以中性假说作为零假设，结合统计检验方法分析DNA数据，被称为“中性检验”。这些方法对于解决一些有关进化的基础理论问题和人类遗传学及生物信息学的深入研究都具有重要意义。本文介绍几个应用广泛的检测方法，以使国内的读者了解它们的基本思路和操作方法。