猪STCH基因的Bi-PASA遗传标记及多态性研究

微粒体应激70蛋白三磷酸腺苷酶(STCH)基因属于应激70蛋白基因伴侣家族，在机体免疫反应和疾病抵抗力等方面起重要作用。根据人和小鼠STCH基因的保守序列设计引物，PCR扩增到猪STCH基因第5外显子445bp片段。序列测定显示，猪STCH基因与人和小鼠STCH基因分别具有87.13%和80.45%的同源性。通过测定和比较中国梅山猪、欧洲约克夏猪及PIC商品猪的STCH基因序列，发现在猪STCH基因编码区第5外显子1050位点上存在一个单碱基突变位点。利用双向特定等位基因PCR扩增法(Bi-PASA)建立了检测猪STCH基因变异的遗传标记，并用该标记分析了STCH基因在中国家猪(梅山猪、荣昌猪和金华猪)、欧洲家猪(约克夏猪、大白猪)、商品猪(PIC合成系)以及欧洲野猪的基因频率和多态性。本研究建立的Bi-PASA遗传标记和基因变异信息，将为进一步分析猪STCH基因变异与经济性状的相关分析提供基础资料。