全部 标题 作者
关键词 摘要

OALib Journal期刊
ISSN: 2333-9721
费用:99美元

查看量下载量

相关文章

更多...
大豆科学  2007 

大豆根际未培养与培养细菌群落结构差异比较研究

DOI: 10.3969/j.issn.1000-9841.2007.06.019, PP. 907-913

Keywords: 大豆,根际,细菌群落,PCR-DGGE

Full-Text   Cite this paper   Add to My Lib

Abstract:

根际土壤微生物群落结构是根际微生态系统中的重要组成部分,与根际养分有效性、植物生长发育及抗病性等关系密切,不同植物间、同一植物的不同基因型之间根际微生物群落结构差异较大。利用从两种基因型大豆根际土壤中直接提取和从平板培养菌落提取的微生物DNA为模板,采用细菌通用引物GC-357f和517r进行PCR扩增,对PCR产物的DGGE图谱进行聚类和主成分分析。结果表明,不同基因型大豆根际土壤未培养的细菌群落结构差异不大,而在土壤浸提液和NA培养基上形成的可培养的细菌群落结构受培养基种类和接种浓度(10-2和10-3)影响较小,但受不同大豆基因型影响而产生了差异。对DGGE条带进行分析表明,大豆根际未培养的细菌群落物种丰富度(S)和多样性指数(H)明显高于可培养细菌,说明培养过程是一个再选择的过程,在这个过程中一些微生物的信号得到放大,而大量的微生物信息缺失。对主要DGGE条带测序显示,大豆根际有三大类细菌:拟杆菌门(Bacteroidetes)、变形杆菌门(Proteobacteira)和放线菌门(Actinobacteria)。变形杆菌门(Proteobacteira)中的γ-Proteobacteria、αProteobacteria和放线菌门(Actinobacteria),在未培养和培养细菌中都表现为优势种群。与培养细菌相比,变形杆菌门中的-β-Protebacteria和拟杆菌门(Bacteroidetes)细菌在可培养细菌中占优势,而在未培养细菌中丰度较低。结果证明,大豆根际细菌经培养后已使原有的群落结构发生改变,影响对原位细菌群落结构的认识。

References

[1]  [1]陈文新,李阜隶.我国土壤微生物学和生物固氮研究的回顾和展望[J].世界科技研究与发展,2003,24(4):612.
[2]  [2]王如华,张启发,周宝利,等.浅析植物根分泌物与根际微生物的相互作用关系[J].土壤通报,2007,38(1):167-172.
[3]  [3]沈瑞清,张萍,康萍芝,等.根际微生物与植物病害关系的研究进展[J].宁夏农林科技,2006,(5):46-48.
[4]  [4]Marschner P,Yang C H,Lieberei R,et al.Soil and plant specific effects on bacterial community composition in the rhizosphere[J].Soil Biology and Biochemistry,2001,33:1437-1445.
[5]  [5]叶姜瑜,罗固源.微生物可培养性低的生态学释因与对策[J].微生物学报,2005,45(3):478.
[6]  [6]张汉波,段昌群,屈良鹄.非培养方法在土壤微生物生态学研究中的应用[J].生态学杂志,2003,22(5):131-136.
[7]  [7]蔡燕飞,廖宗文.土壤微生物生态学研究方法进展[J].土壤与环境,2002,11(2):167-171.
[8]  [8]刘得金,周以飞.福州地区春大豆基因型、播期对产量的效应[J].大豆科学,1991,(3):331-333.
[9]  [9]马淑梅,李宝英.大豆种质资源对大豆疫霉病菌抗病性测定[J].大豆科学,2006,25(3):279-287.
[10]  [10]王萍,王罡,季静.大豆基因型在组织培养条件下对NaCl耐性的研究[J].大豆科学,2006.25(4):421-424.
[11]  [11]李洪连,袁宏霞,王烨,等.根际微生物多样性与棉花品种对黄萎病抗性的关系研究[J].植物病理学报,1999,22(3),242-246.
[12]  [12]Zhou J,Bruns M A,Tiedje J M.DNA recovery from soils of diverse composition [J].Applied and Environmental Microbiology,1996,62:316-312.
[13]  [13]Watanabe T,Asakawa S,Nakamur A,et al.DGGE method for analyzing 16SrDNA of methanogenic archaeal community in paddy field soil [J].FEMS Macrobiology Letters,2004,23(2):153-163.
[14]  [14]Muyzer G,De Waal E D,Uitterlinden A G.Profiling of complex microbial populations by denaturing gradient gel electrophoresis analysis of polymerase chain Reaction amplified genes coding for 16SrRNA [J].Applied and Environmental Microbiology,1993,59:695-700.
[15]  [15]Yang C,Crowiey D E.Rhizosphere microbial community structure in relation to root location and plant iron nutritional status [J].Applied and Environmental Microbiology,2000,66(1):345-351.
[16]  [16]Tscherko D,Hammesfahr U,Marx M C,et al.Shifts in rhizosphere microbial communities and enzyme activity of Poaalpina across an alpine chronosequence [J].Soil Biology and Biochemistry,2004,36:1685-1698.
[17]  [17]Rosell -Mora R,Amann R.The species concept for prokaryotes [J].FEMS Microbiology Reviews,2001,25(1):39-67.
[18]  [18]Dunbar J,Takala S,Barns S M. Levels of bacterial community diversity in four arid soils compared by bacterial groups from soils of the arid southwestern united states that are present in many geographic regions [J].Applied and Environmental Microbiology,1997,63:36l4-3621.
[19]  [19]孙晓棠,姚青,刘琼光,等.利用DGGE评价不同培养基回收番茄根际细菌类群的能力[J].微生物学报,2006,(3):482-486.
[20]  [20]张福锁,申建波.根际微生态系统理论框架的初步建立[J].中国农业科技导报,1999,1(4):15-20.

Full-Text

Contact Us

service@oalib.com

QQ:3279437679

WhatsApp +8615387084133