大豆基因组GmSRK及其同源基因的生物信息学分析

以野生大豆GsSRK氨基酸序列为检索序列，在Phytozome数据库中查找大豆基因组中其同源基因GmSRK。利用Phytozome数据库以及MEGA5.0，ClustalX等软件挖掘大豆基因组GmSRK同源基因，最终确定同源性较高的2个基因Glyma12g21640和Glyma08g06550。对GmSRK、Glyma12g21640和Glyma08g06550这3个基因进行基因结构，染色体定位，蛋白理化性质、一级、二级结构分析，结果表明三者均含有6个内含子，7个外显子；定位于3条不同染色体上；都具有B-lectin，S_locus_glycop，PAN_AP以及S_TKc四个结构域，属于G-type外源凝集素类受体蛋白激酶。进化树分析发现GmSRK与Glyma12g21640亲缘关系最近且与四季豆、苜蓿中同源蛋白聚为一支，Glyma08g06550与拟南芥RLKs亲缘关系较近。