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ISSN: 2333-9721
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大豆科学  2014 

大豆DNA去甲基化酶ROS1的生物信息学分析

DOI: 10.11861/j.issn.1000-9841.2014.03.0321, PP. 321-324

Keywords: 大豆,DNA去甲基化酶,ROS,生物信息学分析

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Abstract:

利用NCBI、Phytozome、ExPASy等网站及其数据库,初步确定了大豆DNA去甲基化酶ROS1的蛋白及基因序列、基因拷贝数、理化特性等,并进一步预测分析了二级结构及结构域,同时结合ClustalX2.0和MEGA4.0等软件进行多重序列比对和分子系统进化关系研究。结果显示,大豆ROS1包括6个拷贝,ROS1各拷贝的分子量相近,等电点酸性,具有相似的潜在磷酸化位点,属于不稳定的疏水性蛋白,都位于细胞核内,且不含信号序列。α螺旋是主要的二级结构,均含有DNA_glycosylase,HhH-GPD_domain和HTH_base_excis_C三个结构域。

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