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ISSN: 2333-9721
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大豆科学  2012 

大豆基因组GmGAI同源基因的生物信息学分析

DOI: 10.3969/j.issn.1000-9841.2012.06.002, PP. 869-873

Keywords: 大豆,?GAI?基因,DELLA结构域,GRAS结构域

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Abstract:

利用Phytozome数据库、NCBI站和MEGA4.0、ClustalX软件对大豆(Glycinemax)基因组中GAI(GAinsensitive)同源基因进行生物信息学分析,发现大豆GAI基因有7个拷贝,都不含有内含子,分别分布于第4、5、6、8、10、11和18号染色体上,它们都属于GRAS家族,都存在DELLA(34-106)和GRAS(158-513)2个结构域。氨基酸序列比对和系统进化树分析表明,大豆GAI的7个拷贝进化距离并不是最近的,而是分别有与之最近的其他物种,推测大豆GAI的7个拷贝在进化的过程中功能上发生了一些变化,对植物的生长发育可能会产生不同的影响。

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