大豆TCP转录因子家族结构域分析及功能预测

利用已知的拟南芥TCP基因和大豆基因组数据库，通过生物信息学方法，鉴定并获得了大豆TCP家族基因序列，基因定位信息。共鉴定大豆TCP基因54个，分布在大豆除14号染色体外的其他19条染色体上。对54个基因进行进化和聚类分析及功能结构域的分析，发现全部具有高度保守的TCP结构域。根据结构域差异和系统发育分析的结果，将大豆TCP转录因子家族分成2个TCP亚家族。以生物信息学手段和已有的其他物种的TCP基因进行了比较分析，大豆TCP基因占总数的3.5%，与拟南芥同源基因比较，序列长度存在相似性。对启动子元件分析显示，TCP基因含有大量与在子叶、根、茎处大量表达有关的元件及对分生组织有作用的元件。