幽门螺杆菌分离株iceA基因克隆及序列分析

？目的克隆幽门螺杆菌中国郑州市慢性萎缩性胃炎患者分离株MEL-Hp27iceA基因,测序后对其进行序列分析。方法根据iceA基因上下游基因序列设计引物,PCR扩增iceA基因,并将其连接至pMD19-T载体,测序后采用相关数据库和生物信息学软件对基因序列进行分析。结果成功克隆幽门螺杆菌Hp27菌株iceA基因序列,扩增产物大小约为790bp;重组质粒pMD19-T-iceA单酶切产生3820bp片段,双酶切产生3000和820bp的2个片段;Hp27iceA基因与大多数美国来源菌株同源性>85%,与日本、印度等地区来源菌株同源性<70%。序列分析结果表明,所克隆到的基因为iceA2亚型,与美国株Alaskastrain219、Alaskastrain213关系最近,同源性分别为87%和95%,与芬兰株Finlandstrain9496等菌株存在聚类关系,同源性88%～93%,与CR9等其他菌株距离较远。结论成功克隆幽门螺杆菌Hp27菌株iceA基因序列;不同地区幽门螺杆菌分离株的iceA基因间存在着一定差异。