全部 标题 作者
关键词 摘要

OALib Journal期刊
ISSN: 2333-9721
费用:99美元

查看量下载量

相关文章

更多...

千里光β-微管蛋白基因结构与功能的生物信息学分析

DOI: 10.11913/PSJ.2095-0837.2014.50487, PP. 487-492

Keywords: 千里光,β-微管蛋白,结构与功能,生物信息学

Full-Text   Cite this paper   Add to My Lib

Abstract:

?β-微管蛋白是影响细胞新陈代谢和行使功能的重要结构物质,研究β-微管蛋白基因的序列信息对揭示其蛋白结构与功能具有重要指导意义。从千里光全长cDNA文库中分离得到β-微管蛋白基因,并采用生物信息学软件进行序列分析。结果显示,该基因长度为1750bp,编码的蛋白质长度为448个氨基酸,与柚子β-微管蛋白的同源性最高,达96%;其蛋白质分子量为50.01kD,理论等电点为4.83。β-微管蛋白二级结构主要组成为无规则卷曲结构和α螺旋结构;结构域分析发现该蛋白具有两个保守结构域;三级结构预测为相对稳固的类球形结构;信号肽分析将该蛋白主要定位于细胞质、过氧化物酶体、线粒体基质等亚细胞器位置。将该基因序列上传至GenBank所获得的登录号为KF887495。本实验结果为千里光β-微管蛋白的作用机制揭示和应用研究提供了基础数据,也为植物β-微管蛋白基因的分子研究提供了理论依据及基础资料。

References

[1]  国家药典委员会.中华人民共和国药典:一部(2010年版)[S].北京:中国医药科技出版社, 2010:32.
[2]  全国中国草药汇编编写组.全国中草药汇编[M].上海:上海科技出版社,1999:1390.
[3]  孟凡君, 张雪君, 谢卫东.中草药千里光研究进展[J].东北农业大学学报, 2010, 41(9):156-160.
[4]  钱刚, 敖弟书, 段鹏敏, 蒋思思, 李有.千里光抗菌作用的数量性状分析[J].武汉植物学研究, 2010, 28(1):67-71.
[5]  闫硕, 朱家林, 朱威龙, 潘李隆, 张青文, 刘小侠.棉铃虫α-微管蛋白基因的克隆、序列分析及表达模式检测[J].中国农业科学, 2013, 46(9):1808-1817.
[6]  Kawasaki H, Sugaya K, Quan GX, Nohata J, Mita K.Analysis of α-and β-tubulin genes of Bombyx mori using an EST database[J].Insect Biochem Molec, 2003, 33(1):131-137.
[7]  Song L, Liu XX, Zhang YA, Zhang QW, Zhao ZW.The cloning and expression of α-tubulin in Monochamus alternatus[J].Insect Mol Biol, 2008, 17(5):495-504.
[8]  李艳, 郭其森.β-tubulin在NSCLC中的表达与抗微管类药物耐药相关性的研究进展[J].中华肺部疾病杂志(电子版), 2013, 6(2):179-183.
[9]  闫硕, 刘小侠, 韩娜娜, 倪慧, 孙洁茹, 张青文.棉铃虫β-微管蛋白基因cDNA序列的克隆与序列分析[J].应用昆虫学报, 2012, 49(1):130-137.
[10]  平军娇, 张珍, 蔡振锋, 汤贤春, 钱刚.千里光全长cDNA文库的构建与分析[J].中草药, 2012, 43(3):557-561.
[11]  Arnold K, Bordoli L, Kopp J, Schwede T.The SWISS-MODEL workspace:a web-based environment for protein structure homology modeling[J].Bioinformatics, 2006, 22(2):195-201.
[12]  Kiefer F, Arnold K, Kunzli M, Bordoli L, Schwede T.The SWISS-MODEL repository and associated resources[J].Nucleic Acids Res, 2009, 37:D387-D392.
[13]  Kirschner M.Mitchison T.Beyond self-assembly:from microtubules to morphogenesis[J].Cell, 1986, 45:329-342.
[14]  Yen TJ, Machlin PS, Cleveland DW.Auto regulated instability of beta-tubulin mRNAs by recognition of the nascent amino terminus of beta-tubulin[J].Nature, 1988, 334(6183):580-585.
[15]  Cleveland DW.Auto regulated control of tubulin synthesis in animal cells[J].Curr Opin Cell Biol, 1989, 1(1):10-14.
[16]  Aroca A, Raposo R, Lunello P.A biomarker for the identification of four Phaeoacremonium species using the β-tubulin gene as the target sequence[J].Appl Microbiol Biot,2008, 80(6):1131-1140.
[17]  Soulages JL, Kim K, Walters C, Cushman JC.Temperature induced extended helix/random coil transitions in a group 1 late embryogenesis abundant protein from soybean[J].Plant Physiol, 2002, 128:822-32.
[18]  黄聪聪, 吴忠义, 陈洁,于荣.植物微管结合蛋白的研究进展[J].植物学通报, 2008, 25(3):354-362.
[19]  Hamada T.Microtubule associated proteins in higher plants[J].Plant Res, 2007, 120(1):79-98.
[20]  Ehrhardt DW, Shaw SL.Microtubule dynamics and organization in the plant cortical array[J].Annu Rev Plant Biol, 2006, 57(1):859-875.

Full-Text

Contact Us

service@oalib.com

QQ:3279437679

WhatsApp +8615387084133