燕麦EST-SSR标记的开发和利用

？为拓展分子标记在燕麦种质资源分析与鉴定中的应用，利用公共数据库中的25376条EST（expressedsequencetags）序列，开展了燕麦EST-SSR功能性标记的开发和利用研究。25376条EST序列经拼接去冗余后获得了11618条序列，从中筛选出含有不同重复基元的SSR且重复次数较多、长度较长的556条EST序列进行引物设计，开发了50对燕麦EST-SSR引物，通过筛选得到40对有效的EST-SSR引物。选取其中4对引物对5个燕麦种质资源进行了PCR扩增及产物测序，结果表明扩增条带多态性是由SSR差异造成的。利用40对EST-SSR引物对15个六倍体燕麦种质资源进行遗传多样性分析，共扩增出89个等位基因，平均每对引物产生2.23个等位基因；UPGMA聚类分析表明，15个六倍体燕麦种质资源在Dice系数为0.93处聚为3支，基本上是按照不同种进行聚类的，在相同种中又根据地理来源分别聚集成支。利用40对EST-SSR引物对31个遗传背景不清的燕麦种质资源进行基因组倍性鉴定，发现这些种质中可能存在有四倍体和二倍体的燕麦新资源。本研究开发的燕麦EST-SSR功能性标记将在燕麦遗传多样性分析、遗传图谱构建及燕麦属内种间基因组鉴定等方面发挥重要作用。