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OALib Journal期刊
ISSN: 2333-9721
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栽培种甘薯及其近缘野生种nrDNAITS序列分析

DOI: 10.3724/SP.J.1142.2014.10040, PP. 40-49

Keywords: 甘薯,nrDNAITS,BLAST,遗传距离,系统发育树

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Abstract:

?采用核糖体DNA内转录间隔区(nrDNAITS)序列比较分析了甘薯及其近缘野生种的遗传多样性及系统进化关系,首次报道了栽培种甘薯‘徐薯18’(Ipomoeabatatas‘Xushu18’)及其近缘野生种I.triloba(DOM),I.cordatotriloba(MEX),I.nil(PER),I.nil(JPN),I.hederaceaJacq.(USA),I.hederaceaJacq.(HK)和种间杂交种67-1(I.batatas‘Xushu18’×I.hederaceaJacq.)及回交种(67-1×I.batatas‘Xushu18’)的nrDNAITS序列。序列分析表明,栽培种甘薯及其近缘野生种nrDNAITS序列长度为570~600bp。其中,ITS1序列为185~209bp,GC含量为53.11%~61.83%;ITS2序列为214~226bp,GC含量为61.21%~72.89%;5.8S序列均为165bp,GC含量为54.55%~55.76%。此外,栽培种甘薯及其近缘野生种ITS序列信息位点均集中在ITS1和ITS2区;与其他甘薯属植物相比,I.wrightiiITS2的末端缺失了6~8个碱基。系统进化分析表明,栽培种甘薯‘徐薯18’(I.batatas‘Xushu18’)和野生种I.triloba、I.cordatotriloba、I.lacunosa、I.trifida的亲缘关系较近,与I.wrightii、I.pes-tigridis、I.grandifolia、I.nil、I.hederaceaJacq.、I.purpurea的亲缘关系较远;杂交后代与栽培种甘薯‘徐薯18’(I.batatas‘Xushu18’)亲缘关系较近,与野生种父本I.hederaceaJacq.的亲缘关系较远。

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