DRE顺式作用元件dsDNA芯片制备

？DRE顺式作用元件能与DREB转录因子特异结合,在诱导逆境(干旱、高盐、低温)基因表达过程中起重要作用。dsDNA(doublestrandDNA)微阵列芯片技术能够有效地检测序列特异性DNA结合蛋白质(转录因子)与大量DNA靶点(顺式作用元件)的特异性结合,可有效分析生物分子结合作用。根据DRE顺式作用元件核心序列设计并化学合成含发夹结构的单链DNA探针,采用TaqDNA聚合酶在片延伸,并对其在片延伸体系的反应温度、Mg2+浓度以及单链探针是否变性等条件进行了优化。结果表明,50℃的反应温度,2.5mmol/L的Mg2+浓度和单链不变性是TaqDNA聚合酶在片延伸的最佳条件。优化方法制备的dsDNA芯片将更有利于DRE顺式作用元件与DREB抗逆转录因子相互作用的研究。