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ISSN: 2333-9721
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拟南芥IQM2cDNA的克隆与生物信息学分析

DOI: 10.3724/SP.J.1142.2010.30353, PP. 353-358

Keywords: 拟南芥,生物信息学,IQM2,RACE

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Abstract:

?拟南芥IQM2由At3g13600编码,是IQM家族的第二个成员,但在各种分子生物学相关的文献和数据库中都找不到其cDNA序列.本研究采用RACE和RT-PCR技术,克隆得到拟南芥IQM2基因的全长cDNA序列.该cDNA长2245bp,其开放阅读框长1818bp,编码1个由605个氨基酸残基组成的多肽链.生物信息学分析表明,IQM2蛋白含有一个IQ基序,属于钙不依赖性钙调素结合蛋白;其N端与豌豆重金属诱导蛋白6(HMIP6)有较高的同源性,而IQ基序则分布在HMIP6结构域内部;其C端与栝楼天花粉蛋白(trichosanthin)N端具有较高的同源性.

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