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ISSN: 2333-9721
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番茄P56和部分来源多糖裂解酶家族Ⅰ的其它蛋白的系统演化分析

, PP. 282-288

Keywords: 果胶酸裂解酶,果胶酸酯裂解酶,多糖裂解酶家族Ⅰ,系统演化树

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Abstract:

?果胶裂解酶包含果胶酸裂解酶(pectatelyase)和果胶酸酯裂解酶(pectinlyase)二种形式,是一类多糖裂解酶,由细菌、真菌、植物和线虫等生物产生,分布在5个多糖裂解酶家族,果胶酶在食品与饮料、纺织与洗涤、制药等工业中有广泛的应用。利用NCBIBLASTX服务器,搜索与番茄P56蛋白氨基酸序列相似且都属于多糖裂解酶家族Ⅰ的果胶裂解酶蛋白序列共28条,用DNAMAN软件分析其保守区,用CLUSTALX8.0软件进行序列比对和Bi-oEdit软件进行文件转换,进一步用PUAP4.0软件构建系统进化树。构建的MP树(phylogenetictrees)和NJ树(neighbor-joining)显示:来自植物的果胶酸裂解酶、真菌的果胶酸酯裂解酶、细菌的果胶酸裂解酶分别可聚为一个独立的类群;相对于细菌果胶酸裂解酶和真菌果胶酸酯裂解酶而言,构巢曲霉(Aspergillusnidulans)的果胶酸裂解酶A和植物的果胶酸裂解酶之间有较近的亲缘关系;细菌Pseudomonassyringae的果胶酸酯裂解酶和真菌的果胶酸酯裂解酶之间的亲缘关系较近。

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