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ISSN: 2333-9721
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草业学报  2010 

结缕草肌动蛋白基因全长cDNA的克隆及序列分析

, PP. 154-163

Keywords: 结缕草,肌动蛋白基因,克隆,序列分析

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Abstract:

根据植物肌动蛋白(Actin)基因编码区的保守序列设计引物,提取结缕草叶片的总RNA,进行RT-PCR。并采用RACE技术扩增出1560bp的Actin基因全长cDNA序列。序列分析表明,该基因的开放阅读框(ORF)为1134bp,编码377个氨基酸,5′非编码区117bp,3′非编码区309bp。所得序列与GenBank中收录的其他植物肌动蛋白核苷酸序列的一致性均在85%以上,氨基酸序列的一致性高达97%以上。将其命名为ZjACT,GenBank登录号为GU290545。根据高等植物肌动蛋白相似性构建的系统进化树显示,结缕草肌动蛋白与大麦和圆锥小麦肌动蛋白之间的亲缘关系最为密切,在进化中分化时间最为接近。进一步分离克隆了结缕草Actin基因的基因组DNA序列(登录号GU290546),它由4个外显子和3个内含子组成。本研究有助于揭示植物Actin基因家族的进化历史,为研究植物Actin基因家族功能和进化上的多样性奠定理论基础,同时也为开展草坪草和牧草Actin基因的功能分析和利用研究提供参考。

References

[1]  郭景康, 陈青云, 戢茜, 等. 拟南芥、水稻和杨树ACTIN家族全基因组分析[J]. 上海大学学报(自然科学版), 2009, 15(4): 426-431.
[2]  Kriticos D, Randall R. A comparison of systems to analyse potential weed distributions[A]. In: Grove R H, Panetta F D, Virtue J G. Weed Risk Assessment[M]. Australia: CSRIO Publishing, 2001: 61-79.
[3]  Meagher R B. Divergence and differential expression of actin gene families in higher plants[J]. International Review of Cytology, 1991, 125: 139-163.
[4]  邵巍, 赖钟雄, 陈义挺, 等. 龙眼胚性愈伤组织肌动蛋白基因(actin)片段的克隆与序列分析[J]. 农业生物技术科学, 2008, 24(3): 40-43.
[5]  Guisan A, Thuiller W. Predicting species distribution: Offering more than simple habitat models[J]. Ecology Letters, 2005, 8: 993-1009.
[6]  Thomas C, Meyer D, Wolff M, et al. Molecular characterization and spatial expression of the sunflower ABP1 gene[J]. Plant Molecular Biology, 2003, 52: 1025-1036.
[7]  Elith J, Graham C H, Anderson R P, et al. Novel methods improve prediction of species’ distributions from occurrence data[J]. Ecography, 2006, 29: 129-151.
[8]  Peterson A T, Soberón J, Sánchez-Cordero V. Conservatism of ecological niches in evolutionary time[J]. Science, 1999, 285: 1265-1267.
[9]  Moniz de Sa M, Drouin G. Phylogeny and substitution rates of angiosperm actin genes[J]. Molecular Biology and Evolution, 1996, 13: 1198-1212.
[10]  Peterson A T. Predicting species’ geographic distributions based on ecological niche modelling[J]. Condor, 2001, 103: 599-605.
[11]  Fletcher L D, McDowell J M, Tidwell R R, et al. Structure, expression and phylogenetic analysis of the gene encoding actin I in Pneumocystis carinii[J]. Genetics, 1994, 137: 743-750.
[12]  孙鹏, 郭玉海, 祁建军. 地黄肌动蛋白基因片段的克隆与序列分析[J]. 安徽农业科学, 2008, 36(20): 8470-8471.
[13]  Kandasamy M K, McKinney E C, Meagher R B. Functional nonequivalency of Actin isovariants in Arabidopsis[J]. Molecular Biology of the Cell, 2002, 13: 251-261.
[14]  Drouin G, Dover G A. A plant processed pseudogene[J]. Nature, 1987, 328: 557.
[15]  Pimentel D, Lach L, Zuniga R, et al. Environmental and economic costs associated with non-indigenous species in the United States[J]. Bioscience, 1999, 50: 53-78.
[16]  Higgins S I, Richardson D M, Cowling R M, et al. Predicting the landscape-scale distribution of alien plants and their threat to plant diversity[J]. Conservation Biology, 1999, 13: 303-313.
[17]  Bernatzky R, Tanksley S D. Genetics of actin-related sequences in tomato[J]. Theoretical and Applied Genetics, 1986, 72: 314-321.
[18]  孙娟, 杨国锋, 陈玉成, 等. 金佛山自然保护区外来入侵植物种及其分布情况[J]. 草业学报, 2009, 18(3): 34-42. 浏览
[19]  高兴祥, 李美, 高宗军, 等.外来物种小飞蓬的化感作用初步研究[J]. 草业学报, 2009, 18(5): 46-51. 浏览
[20]  Reece K S, McElroy D, Wu R. Genomic nucleotide sequence of four rice (Oryza sativa) actin genes[J]. Plant Molecular Biology, 1990, 14: 621-624.
[21]  Weber E. Current and potential ranges of three exotic Goldenrods (Solidago) in Europe[J]. Conservation Biology, 2001, 15(1): 122-128.
[22]  徐汝梅. 生物入侵-数据集成、数量分析与预警[M]. 北京: 科学出版社, 2003.
[23]  万方浩, 郑小波, 郭建英. 重要农林外来入侵物种的生物学与控制[M]. 北京: 科学出版社, 2005.
[24]  车晋滇. 北京市外来杂草调查及其防除对策[J]. 杂草科学, 2004, 2: 9-12.
[25]  刘全儒. 北京及河北植物新纪录[J]. 北京师范大学学报(自然科学版), 2000, 36(5): 674-676.
[26]  高兴祥, 李美, 高宗军, 等. 苍耳对不同植物幼苗的化感作用研究[J]. 草业学报, 2009, 18(2): 95-101. 浏览
[27]  车晋滇, 胡彬. 外来入侵杂草意大利苍耳[J]. 杂草科学, 2007, 2: 57-59.
[28]  刘慧圆, 明冠华. 外来入侵种意大利苍耳的分布现状及防控措施[J]. 生物学通报, 2008, 43(5): 15-16.
[29]  吴冬, 黄妹博, 李宏庆. 意大利苍耳二形性种子萌发、植株生长差异及生态适应性[J]. 生态学报, 2009, 29(10): 5258-5264.
[30]  萧德荣, 周定国. 21世纪世界地名录[M]. 北京: 现代出版社, 2001.
[31]  国家测绘局地名研究所. 中国地名录[M]. 北京: 中国地图出版社, 1997.
[32]  周兆叶, 王志伟, 九次力, 等. GIS技术在生态环境状况评价方面的应用[J]. 草业科学, 2009, 10: 52-58.

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