登革病毒中国株E基因重组的生物信息学分析

目的：了解我国登革病毒（Denguevirus，DV）包膜蛋白基因（Envelope，E）重组的发生情况。方法：从GenBank收集共70个DV中国株的E基因序列，Clustal-W比对后，重组检测软件包RDP3检测E基因中可能存在的重组事件，并经Mega4构建系统发生树验证所检测的重组事件的可靠性和真实性。结果：DV-1型中E基因区存在3个重组事件，共4个重组子，分别是1995、1997、1999年和2004年分离的DV病毒株，在其它3个血清型的DV病毒株中没有检测到重组，也未检测到血清型间重组。结论：我国ＤＶ1型血清型E基因区域存在基因重组。