凝血酶适体DNA四螺旋构象去折叠机制的NMR研究

凝血酶适体DNA\[thrombinbindingDNAaptamerd(G1G2T3T4G5G6T7G8T9G10G11T12T13G14G15)，TBA]是对凝血酶有极高亲和性、并能有效抑制凝血酶凝血功能的单链DNA适体.凝血酶适体DNA在K+等离子存在时呈现出椅式构象，其中2个堆积的四碱基体（G-quartet）构成椅子的主体部分，而1个TGTloop环和2个TTloop环分别构成椅子的靠背和椅脚.我们测定了在K+存在时凝血酶适体DNA中亚氨基质子的交换速率，发现位于TGTloop环和TTloop环内的亚氨基质子G6、G5和G14由于受TGTloop环和TTloop环的保护有比较小的交换速率，而位于环之外的亚氨基质子G2、G11和G15有较大的交换速率；？TGTloop环稳定性同TTloop环相似；碱基T4、T13和T9在稳定凝血酶适体DNA结构中起着很大的作用.这些证据进一步支持了凝血酶适体DNA的去折叠机制：位于TGTloop环和TTloop环之外的碱基对G1G15、G2G14和G5G11首先断裂其Hoogsteen氢键，而TGTloop环、TTloop环和其内的Hoogsteen氢键保持完好；当温度进一步升高时，TGTloop环和两个TTloop环打开环状结构，凝血酶适体DNA的椅式构象彻底解体，转变为自由单链.